Bayındırlık Bakanlığı'na bağlı Toprak Kimyası Dairesi 1903 yılında kuruldu. Su koşulları ve bunların pamuk verimliliğine etkisi ile Nil Vadisi toprağının organik ve inorganik gübrelenmesi üzerine araştırma çalışmaları ve rutin analizler başlatıldı.
Çiftçilere ve devlet kurumlarına su, toprak, gübre, bitki, gıda ve yem analizleri ile ilgili hizmetler sağlamak amacıyla 1911 yılında özel bir laboratuvar kuruldu.
1913 yılında, ana dallarından biri toprak kimyası olan Ziraat Dairesi kuruldu. O zamandan beri,
Bölümler, tarımsal çiftlik üretimine yönelik araştırma ve katkılarından dolayı uluslararası tanınma kazanmıştır.
Dünyadaki diğer beş büyük tarım merkezi gibi bu bölüm de uzun vadeli gübre denemeleriyle ünlüydü.
Yeni Bitki Fizyolojisi ve Bitki Besleme Bölümü 1957 yılında kuruldu.
Bitki beslenmesi ve su ihtiyacı olmak üzere iki ana dal ile. 1960 yılında toprak etüdü ve iyileştirme, toprak araştırmaları, tarımsal mikrobiyoloji ve toprak analizine yönelik dört bölümü içeren Toprak Genel İdaresi kuruldu. 1971'de
Toprak ve Su Araştırma Enstitüsü (SWRI), Tarım, Hayvan Zenginliği, Balıkçılık ve Arazi Islahı Bakanlığı bünyesinde Tarımsal Araştırma Merkezi'nin (ARC) bağımsız bir enstitüsü olarak örgütlenmiştir. 1920 yılında 5 kişilik teknik personel sayısı bugün 419'a çıkmıştır.